Forschungsdatenmanagement der Medizinischen Fakultät
Kontakt: forschungsdaten@medizin.uni-leipzig.de
Telefon: 0341 – 97 16794 (Christof Meigen)
0341 – 97 15981 (Marcel von Borzestowski)
Studienmanagement:
REDCap
- Was ist das?
-
- Komplettes System zur Studienverwaltung
- Onlinefragebögen, Metadatenverwaltung, Qualitätsmanagement, Reporting
- Verwendung in multizentrischen Studien, für Verwaltungsaufgaben, Promotionsprojekte, langfristige Register
- Was bieten wir?
- Nutzerverwaltung/Support
- Schulungsunterlagen
- Unterstützung bei anspruchsvolleren Projekten (komplexe Studiendesigns, App, API-Zugriff, skriptgesteuerte Importe)
Klardaten & Pseudonymverwaltung:
LEIM/E-PIX
- Was ist das?
- LEIM ist eine einfache Web-Oberfläche für E-PIX/gPAS mit Weiterleitung zu REDCap/XNAT
- Die E-PIX/gPAS-Dienste werden von der Treuhandstelle des Datenintegrationszentrums betrieben
- Personen und Pseudonyme erfassen/erstellen, Rechte vergeben, Laufzettel mit QR-Code drucken
- Was bieten wir?
- Support
- Unterstützung bei Layoutvorlagen (z.B. für Laufzettel)
MRT-Bildverwaltung:
XNAT
- Was ist das?
- Bild/MRT-Datenbank für den Forschungsbereich
- Einfacher Upload von MRT-Bildern mit Pseudonymisierung
- Funktionen zur Vorschau/Markierung (ROI) und automatisierten Verarbeitung
- Was bieten wir?
- Nutzerverwaltung/Support
- Einführung API-Zugriff
- Unterstützung bei der Integration eigener Pipelines
Elektronisches Laborbuch:
elabFTW
- Was ist das?
-
- Elektronisches Laborbuch zur Protokollierung aller Arbeitsschritte im Labor
- Rechtssichere Signierung von Experimenten durch Zeitstempeldienst des Deutschen Forschungsnetzes
- Strukturierte Datenverwaltung durch Vorlagen, Verschlagwortung, nutzerdefinierte Formulare
- Detaillierte Rechtevergabe durch Teams/Gruppen
- Elektronisches Laborbuch zur Protokollierung aller Arbeitsschritte im Labor
- Was bieten wir?
- Nutzerverwaltung/Support
- Unterstützung bei der Erstellung von Vorlagen, Formularen, Strukturierung der Inventarverwaltung
- Einführung in die Nutzung der API
Mikroskopiedatenverwaltung:
OMERO
- Was ist das?
- Mikroskopie-Bilddatenbank für den Forschungsbereich, insbesondere für große Bilddaten
- Komfortabler Client zum Hochladen großer Datenmengen
- Plugins für ImageJ, QPath, CellProfiler u.a.
- Schrittweise Vorschau ohne Herunterladen der kompletten Bilddatei
- Was bieten wir?
- Nutzerverwaltung/Support
- Einführung API-Zugriff
- Unterstützung bei Entwicklung eigener Import-/Analyseskripte